【目的】揭示黑老虎5个群体70份种质资源的遗传多样性水平和遗传结构状况，为种质资源评价、保护及利用提供理论依据。【方法】用筛选出的17对引物进行所有样本SSR-PCR扩增，扩增产物经毛细管电泳后采用Gen Alex v6.502、Ntsys V2.2及Structure 2.3.4等软件进行遗传多样性和遗传结构分析。【结果】17对引物的70份样本中共检测到147个等位基因，平均每对引物扩增出8.647个等位基因。17个位点的Shannon信息指数(I)平均值为1.421，期望杂合度(He)平均值为0.648，多态信息指数(PIC)平均值为0.612。5个群体中马关群体(MGH)的遗传多样性最高，I和He分别为1.070和0.544。群体遗传分化系数(Fst)平均值为0.323，有32.3%的变异来源于群体间。分子方差分析(AMOVA)显示群体间方差分量比为28.8%，群体间的遗传变异占总变异量的28.8%。17个位点群体内近交系数(Fis)的平均值为0.161(Fis>0)，黑老虎存在较强的近亲交配，5个群体中只有广西群体(GXH)Fis<0。基因流(Nm)为0.876，属中等水平。UPGMA聚类和STRUCTURE分析将70份黑老虎种质资源划分成了3个类群：类群Ⅰ由来自于MGH的样本资源组成，类群Ⅱ主要由屏边群体(PBH)的样本资源组成，类群Ⅲ主要由GXH、贵州群体(GZH)及湖南群体(HNH)的样本资源组成。【结论】黑老虎种质资源具有丰富的遗传多样性，群体间存在极高的遗传分化，遗传变异主要来源于群体内的个体。大部分种质的遗传背景比较单一，同一群体的不同种质遗传组分基本相同。在黑老虎育种及资源保护和开发工作中，应在尽量涵盖全部群体类别的基础上，特别重视遗传多样性丰富的群体以及各群体内不同类型个体的选择、保存和利用。
