摘要：为了探讨西门塔尔牛脆性X智力低下基因1（Fragile X mental retardation gene 1，FMR1）的生物学功能，并为研究FMR1在西门塔尔牛屡配不孕中发挥的作用提供数据支持。实验以西门塔尔牛血液DNA为模板，通过PCR方法克隆FMR1基因完整的5′UTR序列；与NCBI提供的牛FMR1基因mRNA全序列进行比对；利用在线软件进行遗传分析并构建系统进化树，分析FMR1基因5′UTR端脆性；分析该基因编码蛋白的理化性质、亲疏水性、磷酸化位点、跨膜结构、信号肽、二级结构、三级结构和互作蛋白。结果表明：西门塔尔牛FMR1基因5′UTR序列与NCBI提供的牛FMR1基因序列基本一致，生信分析得到牛FMR1基因最长开放阅读框1 710 bp，基因共编码569个氨基酸，分子量64 221.90 u，其编码蛋白是不稳定的亲水蛋白，没有明显的信号肽切割位点，并且不包括跨膜螺旋，二级结构预测表示其主要以α螺旋和无规则卷曲形式为主。说明西门塔尔牛FMR1基因编码序列长度为40 254 bp，编码569个氨基酸，编码的蛋白质为亲水不稳定蛋白，与绵羊遗传距离最近。
文章目录
1 材料与方法
1.1 试验动物
1.2 主要试剂
1.3 主要仪器
1.4 DNA提取
1.5 PCR扩增及克隆
1.6 生物信息学分析
2 结果与分析
2.1 DNA提取
2.2 PCR扩增及克隆
2.3 生物信息学分析
2.3.1 遗传距离分析及系统进化树构建
2.3.2 理化性质分析
2.3.3 疏水性预测
2.3.4 N-糖基化位点预测
2.3.5 FMR1蛋白跨膜区及信号肽预测
2.3.6 二级结构和三级结构预测
2.3.7 功能结构预测及蛋白互作分析
3 讨论
