玉米叶绿素含量的全基因组关联分析及候选基因挖掘

2024-06-06 分子植物育种220 1.05M 0

  摘要:叶绿素是玉米吸收、传递和转换光能的关键色素,对调节玉米的光合生理和产量发挥着重要作用。为解析玉米叶绿素含量的遗传基础,本研究以248份玉米自交系为材料,分别于2018、2019年种植于河北保定和河北辛集,并测定苗期和吐丝期的叶片叶绿素相对含量。对4个环境的表型数据进行最优线性无偏预测,结合群体的SNP基因型信息,使用5种多位点GWAS模型(FASTmrEMMA、FASTmrMLM、ISIS EM-BLASSO、mrMLM和pLARmEB)进行叶绿素含量的全基因组关联分析。苗期和吐丝期分别检测到91个和98个SNPs与叶绿素含量显著关联,其中两种及两种以上模型共同检测到38个显著SNP位点,进一步查找到95个得到注释的候选基因,涉及合成、运输、代谢等过程。通过候选基因的序列分析和功能注释,发现其中GRMZM2G062788和GRMZM2G000256分别调控光合作用的碳同化和析氧反应。苗期和吐丝期叶绿素含量的相关基因表达不同,苗期侧重于生物发生过程的遗传表达,而吐丝期侧重于对光的应激运动。以上研究结果为玉米叶绿素含量的遗传改良和高光效育种提供了参考信息。

  文章目录

  1结果与分析

  1.1叶绿素含量的描述统计

  1.2 苗期和吐丝期叶绿素含量的方差分析

  1.3 苗期和吐丝期叶片叶绿素含量的相关分析

  1.4 叶绿素含量的全基因组关联分析

  1.5 叶绿素含量的候选基因分析

  2讨论

  3材料与方法

  3.1试验材料与田间试验设计

  3.2叶绿素含量的测量

  3.3数据处理

  3.3.1表型数据统计分析

  3.3.2表型值的最优线性无偏预测

  3.3.3叶绿素含量的关联分析

  3.3.4候选基因的挖掘



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