摘要:目的 筛选出子宫内膜癌独立预后相关的核苷酸小RNA(miRNAs),并构建miRNAs风险模型评价患者预后。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载子宫内膜癌(UCEC)miRNAs表达信息和相应的临床数据,依次进行单因素和多因素回归分析构建出最佳miRNAs风险模型。通过生存分析和受试者工作特征曲线(ROC)对miRNAs风险模型进行评价。最后通过miRNAs数据库对模型调控靶基因进行预测,结合KEGG和GO富集分析模型miRNAs靶基因的功能。结果 经过单因素的Cox回归分析筛选出9个UCEC预后相关的独立miRNAs,然后进一步通过多因素回归分析训练出最佳miRNAs模型,模型评分=(0.257×Exphsa-miR-1269a)+(0.437×Exphsa-miR-10b-5p)+(0.586×Exphsa-miR-940)+(0.721×Exphsa-miR-3127-5p)-(0.577×Exphsa-miR-1271-5p)。通过生存分析对miRNAs预后模型进行检验后发现,miRNAs风险模型高风险评分患者的5年生存率明显低于低风险评分的患者,进一步通过ROC曲线对风险模型效能进行检验,结果表明miRNAs风险模型对于UCEC患者预后评估具有较好的预测价值。KEGG和GO靶基因富集分析后发现,miRNAs模型能够发挥调控细胞连接和细胞基质生物活性信号和cGMP-PKG、Wnt、黏着斑激酶信号通路等作用。结论 成功构建和评价了子宫内膜癌miRNAs风险预后模型,为临床上子宫内膜癌诊断和预后评估提供了参考。
文章目录
1 材料和方法
1.1 数据采集和处理
1.2筛选和构建预后相关的miRNAs风险预后模型
1.3 miRNAs模型评价与验证
1.4 miRNAs靶基因预测
1.5 GO和KEGG功能预测
2 结果
2.1差异miRNAs与mRNAs的筛选
2.2风险预后相关miRNAs模型构建
2.3 miRNAs模型评价与分析
2.4 miRNAs靶基因预测
2.5 GO和KEGG功能预测
3 讨论