摘要：菌株S10是从仿刺参肠道中分离出的一株具有较高酶活的高产褐藻胶裂解酶菌株。为了详细解析菌株S10的基因组序列信息，进而深入挖掘与褐藻胶裂解酶相关的基因资源。本研究通过形态学观察和16S rRNA序列分析对菌株S10进行了菌种鉴定，然后利用Illumina二代测序技术和第三代高通量PacBio测序平台对菌株S10进行全基因组测序，并使用相关软件对测序数据进行基因组组装、基因预测及基因功能注释等。此外，根据注释结果对菌株S10中所含的3组假定褐藻胶裂解酶基因序列进行生物信息学分析及结构预测。结果表明，菌株S10被鉴定为Vibrio alginolyticus，基因组总长度为5 397 046 bp，GC含量为44.59%，由两条染色体和一条质粒组成。预测共有4 936个编码基因，127个tRNA基因和37个rRNA基因。在COG、GO、KEGG和CAZy数据库中分别注释到4 039、3 163、3 104和96个功能基因。此外，在菌株S10中发现了3组潜在的褐藻胶裂解酶基因alg4755、alg4756和alg4760。生物信息学分析表明，褐藻胶裂解酶Alg4755、Alg4756和Alg4760均属于多糖裂解酶家族7（PL7）蛋白，具有3个PL7家族高度保守的基序（R*E*R，Q(I/V)H，Y*KAG*Y*Q）。综上，S10菌株全基因组测序及分析对该菌的高效产酶机制研究和新型褐藻胶裂解酶的挖掘具有重要意义，也为后期酶的表达及工业化应用提供理论基础。
文章目录
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
1.2 仪器与设备
1.3 方法
1.3.1 菌株鉴定
1.3.2 菌株S10基因组DNA的提取
1.3.3 全基因组测序及组装
1.3.4 基因预测及基因组圈图的绘制
1.3.5 基因功能注释
1.3.6 褐藻胶裂解酶的生物信息学分析
1.3.7 结构预测及分子对接
2 结果与分析
2.1 菌株鉴定
2.2 菌株S10 基因组的基本信息
2.3 基因功能注释
2.3.1 COG数据库注释
2.3.2 GO数据库注释
2.3.3 KEGG数据库注释分析
2.3.4 CAZy数据库注释
2.3.5 3种褐藻胶裂解酶的生物信息学分析
2.3.6 结构预测
2.3.7 分子对接
3 讨论与结论
