上海市普陀区儿童感染性腹泻病例病原谱及分子特征

2024-06-09 上海预防医学60 1.36M 0

  摘要:【目的】 了解2018—2023年上海市普陀区儿童感染性腹泻病的病原谱和分子特征,为儿童感染性腹泻防控提供科学依据。【方法】 收集2018年1月—2023年12月上海市普陀区儿童腹泻病监测哨点医院就诊病例的粪便标本,通过分离培养11种细菌和实时荧光聚合酶链反应法(PCR)检测5种病毒。使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)标准分型法分析部分阳性菌株的分子分型;采用逆转录PCR方法扩增部分诺如病毒阳性标本的聚合酶-衣壳蛋白链接区,基因测序后使用生物信息软件进行分析。采用χ2检验或Fisher精确概率法比较2018—2019年和2020—2023年病原体阳性率。【结果】 707例病例中,总阳性率为47.67%,单一细菌阳性率为16.27%,单一病毒阳性率为22.63%,混合阳性率为8.77%。优势病原体为轮状病毒(10.75%)、诺如病毒(10.33%)、肠致病性大肠杆菌(8.06%)、沙门菌(6.36%)、肠集聚性黏附大肠杆菌(5.52%)、弯曲菌(5.23%)。夏秋季以细菌感染为主,冬春季以病毒感染为主。2020—2023年总阳性率较2018—2019年下降(χ2=5.573,P<0.05)。37株沙门菌、81株肠致泻性大肠杆菌、19株弯曲菌完成PFGE分子分型分析,分别分为28种、80种和18种带型,带型相似度范围较广。19份诺如病毒GⅡ组基因序列分析后分为5种基因型,主要为GⅡ.Pe-GⅡ.4型和GⅡ.P16-GⅡ.2型。【结论】 轮状病毒、诺如病毒、肠致泻性大肠埃希菌、沙门菌、弯曲菌为上海市普陀区儿童感染性腹泻的优势病原体,病原谱呈现季节性流行特征,部分病原体的分子特征存在多样性。应在不同季节加强儿童感染性腹泻病原体的分子特征监测,为防控提供实验室依据。

  文章目录

  1 对象与方法

  1.1 对象

  1.2 方法

  1.2.1 实验室检测

  1.2.2 质量控制

  1.3 统计学分析

  2 结果

  2.1 病原谱构成

  2.2 病原谱变化

  2.3 沙门菌、肠致泻性大肠杆菌和弯曲菌的PFGE分子分型

  2.4 诺如病毒基因型和遗传进化

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