摘要：金针菇菌柄是其主要可食用部位，但是对菌柄伸长的调控机理了解不够深入，相关基因报道较少。本研究以工厂化栽培黄色金针菇为研究对象，分析菌柄上、中、下三个部位的伸长特性，并进行比较转录组学分析和qRT-PCR验证。结果显示，黄色金针菇菌柄伸长区位于上部，中部与下部相比的差异基因共532个，而上部与中部相比的差异基因达3 522个。上部与中部相比的差异基因GO分子功能注释主要包括核糖体结构组成、结构分子活性、运输活性和跨膜转运蛋白活性；KEGG分析则显示上调基因显著富集到核糖体、类固醇生物合成、DNA复制等通路，下调基因显著富集到次生代谢物和氨基酸的生物合成、糖酵解等代谢途径。差异倍数最高的基因包括几丁质酶和糖基水解酶以及转录因子等，qRT-PCR结果证明转录组数据准确可靠。本研究全面展示可能参与金针菇菌柄伸长调控的途径和候选基因，为后续基因功能研究和金针菇的分子育种提供基因资源。
文章目录
1材料与方法
1.1供试菌株
1.2培养基质和培养条件
1.3金针菇RNA提取
1.4 cDNA文库构建和转录组测序
1.5 差异表达基因筛选和富集分析
1.6实时荧光定量PCR（quantitative Real-time fluorescence PCR，qRT-PCR）
2结果与分析
2.1金针菇菌柄伸长特性
2.2转录组数据分析
2.3差异表达基因鉴定
2.4差异基因富集分析
2.5候选基因功能注释及分析
2.6差异表达的转录因子分析
2.7转录组数据的qRT-PCR验证
3讨论
