摘要:本文旨在筛选与硒都黑猪肌内脂肪(IMF)含量相关的候选基因和分子标记,为优质猪的培育提供参考。已有研究表明乙醛酸和二羧酸代谢通路参与脂肪酸合成和分解代谢,进而影响IMF含量。针对通路中候选基因MCEE和PCCA进行测序发现2个SNP位点,其中基因MCEE的g.144001513 A>G位点和基因PCCA的g.68930136 G>A位点均位于第1内含子区域,在硒都黑猪群体中进行关联分析,发现2个位点均与IMF性状显著关联。通过基因互作分析发现,与IMF性状相关的候选基因MCEE(g.144001513 A>G)和PCCA(g.68930136 G>A)互作效应显著。通过蛋白互作预测分析发现,基因MCEE和PCCA所表达的蛋白在猪中共表达。本研究发现位于乙醛酸和二羧酸通路中的MCEE和PCCA基因多态性对硒都黑猪IMF性状有显著影响,可以作为IMF性状选育的重要候选基因,研究结果可为猪IMF沉积提供遗传素材。
文章目录
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 基因变异位点筛选
1.3 关联分析和互作分析
2 结 果
2.1 MCEE和PCCA基因多态性检测
2.2 关联分析
2.3 基因互作分析
2.4 互作蛋白预测
3 讨 论
4 结 论