摘要：生长调节因子互作因子GIF(GRF-Interacting Factor)是植物中一类具有SSXT(SNH)保守结构域的共转录激活因子，与生长调节因子GRF(Growth-Regulating Factor)共同参与调节植物生长发育、生殖发育、形态结构建成和逆境胁迫响应等生理过程。紫花苜蓿(Medicago sativa)是重要的牧草种类，生长发育和形态结构直接影响牧草产量。前人已研究报道了紫花苜蓿MsGRF基因家族，但对GIF基因家族仍缺乏系统了解。本研究通过生物信息学分析，对紫花苜蓿“新疆大叶”(Medicago sativa cv. ‘Xinjiang Daye’)GIF基因家族进行鉴定与分析，为探究MsGIFs的功能和苜蓿遗传改良及新品种创制奠定基础。分析结果表明，在全基因组发现MsGIF基因17个，基因大小为156～702 bp，不均匀地分布在14条染色体上，可进一步分为三个亚家族。此外，MsGIFs氨基酸序列长度在51～233 aa之间，蛋白质分子量在5773.55～24996.80 Da之间，蛋白质等电点在5.07～6.49之间，均是亲水性蛋白质，亚细胞定位预测结果表明多在细胞核，与其基因表达调控功能一致。本文还对MsGIF基因家族基因结构、蛋白质二级和三级结构、启动子顺式作用元件及物种内基因共线性关系进行分析。为探究GIF在牧草生长发育和株型建成等过程中的生物学功能提供一定的参考。
文章目录
1结果与分析
1.1 MsGIF基因家族的鉴定及染色体定位
1.2 GIF系统进化分析
1.3 MsGIF蛋白理化性质分析
1.4 MsGIF氨基酸Motif、蛋白质保守结构域、基因结构分析
1.5 MsGIFs蛋白质二级和三级结构分析
1.6 MsGIF启动子顺式作用元件分析
1.7 MsGIF基因共线性分析
2讨论
3材料与方法
3.1紫花苜蓿GIF基因家族的鉴定
3.2基因在染色体上定位分析
3.3系统进化分析
3.4蛋白理化性质分析
3.5 氨基酸Motif、蛋白质保守结构域和基因结构分析
3.6蛋白二级和三级结构分析
3.7顺式作用元件分析
3.8基因重复和共线性分析
