摘要:目的 评估靶向高通量测序(targeted next-generation sequencing, tNGS)在鉴别诊断结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex, MTBC)及非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria, NTM)感染中的应用价值。方法 收集广州市胸科医院2023年8月—2025年1月收治的466例疑诊分枝杆菌病的住院患者,采集痰液、支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid, BALF)及其他类型样本共506份,分别采用tNGS法与传统诊断方法(涂片、分枝杆菌培养及菌种鉴定、分子生物学检测)鉴别诊断MTBC和NTM,评估tNGS法的检测效能。结果 tNGS法对MTBC的检出率为30.27%,稍高于培养鉴定/分子生物学的26.99%,但差异无统计学意义(P=0.26);tNGS法对NTM的检出率为28.83%。分样本类型分析显示,痰液、BALF及其他样本中tNGS法对MTBC检出率分别为37.50%、28.07%及36.84%,均高于培养鉴定/分子生物学的35.42%、25.13%及21.05%,其差异同样未达到统计学意义(P=0.76、0.36和0.28)。同时,本研究纳入的148例tNGS法检测为MTBC阳性患者中,分枝杆菌培养鉴定为MTBC的占比47.97%,鉴定为NTM的占比4.06%,分枝杆菌培养阴性的占比47.97%,分枝杆菌培养鉴定为MTBC的tNGS序列数显著高于培养阴性组(P<0.05);此外,涂片及分子生物学阳性组的tNGS序列数亦显著高于对应阴性组(均P<0.05)。以培养鉴定/分子生物学为参照标准,tNGS法检测MTBC的灵敏度、特异度及Kappa值分别为84.85%、89.92%和0.72。结论 tNGS技术对MTBC检测具有高灵敏度和快速的优点,可为结核病早期鉴别诊断提供有效支持。
文章目录
1材料与方法
1.1 样本来源
1.2方法
1.2.1 tNGS法
1.2.2 分枝杆菌培养及菌种鉴定(简称“培养鉴定”)
1.2.3抗酸杆菌涂片检测
1.2.4分子生物学检测
1.2.5结核病诊断标准
1.3统计学分析
2. 结果
2.1 患者临床资料
2.2 tNGS法与培养鉴定/分子生物学对MTBC检测比较
2.3 同一患者不同样本类型的MTBC鉴定情况比较
2.4 tNGS法与传统MTBC诊断方法的一致性及序列数相关性分析
2.5 tNGS法鉴别诊断MTBC效能评价
3. 讨论