摘要：为了培育粳稻优质品种，以粳稻139个种质构成的自然群体为材料，测定其垩白度、垩白粒率，并结合重测序获得的1800920个多态性SNPs进行全基因组关联分析（GWAS）。同时对2个性状共同检测到的候选区间内所有基因进行基因注释和单倍型分析。结果表明，2个外观品质性状均存在着广泛的变异，共检测到5个共同控制稻米垩白粒率、垩白度相关QTLs，在候选区间内筛选出2个与垩白粒率和垩白度相关的候选基因。LOC＿Os11g17440编码烯酰辅酶A水合酶/异构酶家族蛋白，包括3种单倍型，具有Hap1和Hap3种质的垩白粒率和垩白度极显著低于Hap2；LOC＿Os11g17620编码表达蛋白，包括2种单倍型，具有Hap1种质的垩白粒率和垩白度极显著低于Hap2。通过GWAS分析初步挖掘出LOC＿Os11g17440和LOC＿Os11g17620可作为共同控制垩白性状的候选基因。
文章目录
1材料与方法
1.1试验材料
1.2数据分析
2结果与分析
2.1稻米垩白相关指标统计
2.2 相关性分析
2.3全基因组关联分析
2.4候选基因筛选
3讨论与结论
