摘要:针对疾病预测方法中忽略微生物相互作用问题,提出基于宿主—微生物双层网络的疾病预测算法。利用微生物测序信息与系统发育树构建宿主—微生物网络,应用重启随机游走算法在网络上进行传播,结合先验微生物,识别与疾病相关的微生物模体,构造模体特征并纳入模型中进行疾病预测。实验结果显示,在结直肠癌的检测中,逻辑回归的AUC值从0.84提升至0.90,随机森林的AUC值从0.88提升至0.92。
文章目录
1 构建疾病预测算法
1.1 基于宿主—微生物网络的网络传播
1.2 模体检测
1.3 疾病预测
2 实验设置与结果讨论
2.1 数据集获取与预处理
2.2 实验过程
2.3 评估指标
2.4 结果分析
3 结论