本文基于20世纪50年代院系调整这一史实,将跨城市各院系净调入数量作为当代高校学科质量的工具变量,在学科层面考察高校学科质量对城市科技创新水平的异质性影响。本文发现:高校学科得分排名提高一个百分位,与该学科对应的城市专利申请数与专利被引用数将分别增加0.6%、1.2%;高校学科质量对城市科技创新结构的影响仅存在于中高技术行业,且在东部沿海地区总体上弱于其他地区;校企间联合研究开发、社会机构引用本地高校专利数量的提升、本地劳动力市场的人力资本改善是高校优势学科溢出效应的重要渠道。对于培育战略性新兴产业、发展自主可控技术等战略目标,本文的研究结论具有重要的政策启示。