谷子B3转录因子可变剪切体分析

2024-05-18 浙江农业学报260 1.66M 0

  摘要:通过分析不同谷子品种B3转录因子基因存在的可变剪切类型,鉴定出具有功能活性的可变剪切体,并分析这些可变剪切体与谷子抽穗期是否具有相关性,为深入揭示B3转录因子可变剪切对谷子生长发育的调控作用提供依据。选择12份不同抽穗期的谷子材料,利用反转录PCR(reverse transcription PCR, RT-PCR)技术克隆了一个REM家族的B3转录因子基因,通过序列比对鉴定该基因存在的可变剪切体类型,分析这些可变剪切体的活性及其与抽穗期的关系。结果表明,B3转录因子基因在这12个谷子品种间共产生了8种可变剪切体,其中可变剪切体Ⅴ包含的品种最多(4个),其次为可变剪切体Ⅳ(2个),其余6种可变剪切体均只包含1个品种;通过可变剪切,12个品种的B3转录因子基因共可编码10种蛋白质,其中5种缺失B3 DNA结合域;Ⅱ型蛋白质具有缩短谷子抽穗期的功能,Ⅵ型蛋白质具有延长谷子抽穗期的功能,且这种作用不受地理环境影响。B3转录因子通过可变剪切参与谷子抽穗期的调控。

  文章目录

  1 材料与方法

  1.1 材料

  1.2 方法

  1.2.1 谷子RNA提取与B3转录因子基因的扩增

  1.2.2 目的基因的回收、连接、转化与测序

  1.2.3 可变剪切体分析

  2 结果与分析

  2.1 B3转录因子基因基因克隆

  2.2 B3转录因子基因cDNA序列、蛋白质序列比对分析

  2.3 B3转录因子基因编码蛋白质结构域分析

  2.4 B3转录因子基因编码蛋白质与抽穗期关系

  3 结论与讨论



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