基于生物信息学分析预测和验证实验性自身免疫性心肌炎的关键基因

2024-05-20 武汉大学学报(医学版)80 3.55M 0

  目的:研究实验性自身免疫性心肌炎(EAM)的分子机制,确定EAM的新生物标记物和靶点,为心肌炎的诊断和治疗提供新的见解。方法:通过差异表达分析GEO数据库中EAM相关数据集GSE155423,筛选出差异表达基因(DEGs)。利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络(PPI)。利用Cytohubba筛选出枢纽基因。利用支持向量机-递归特征消除(SVM-RFE)和随机森林(RF)机器学习算法筛选枢纽基因中的关键基因。最后,这些枢纽基因在脂多糖(LPS)诱导的心肌损伤模型中得到了进一步验证。结果:在GSE155423中确定9个枢纽基因。进一步发现了两个关键基因:Cxcl9和Cxcl10。通过实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应和蛋白质印迹分析验证了Cxcl10在LPS诱导的心肌损伤模型中的高表达。结论:Itgax、Ccl5、Cxcl10、Ifng、Csf2、Cxcl9、Il6、Foxp3和Il1b与EAM的发生发展密切相关。Cxcl10基因可能是EAM发生机制中的一个关键靶点。



您还没有登录,请登录后查看详情



 

1/26专辑:论文下载

举报收藏 0打赏 0评论 0
相关文档
本类推荐
下载排行
网站首页  |  关于我们  |  联系方式  |  用户协议  |  隐私政策  |  版权声明  |  网站地图  |  排名推广  |  广告服务  |  积分换礼  |  网站留言  |  RSS订阅  |  违规举报  |  蜀ICP备2024057410号-1