番茄LeGlyI基因的生物信息学特征与表达模式分析

2024-05-20 山东农业科学160 0.92M 0

  摘要:植物在遭受逆境胁迫时会产生过量的甲基乙二醛(MG)等有毒醛类化合物,而乙二醛酶系统能帮助其有效清除过量的MG,其中乙二醛酶Ⅰ(GlyⅠ)是级联反应的第一个酶,在此过程中发挥了重要作用。本研究以野生番茄‘Heinz 1706’的幼苗为试材,克隆了番茄LeGlyI基因,并对其生物信息学特征、表达模式以及亚细胞定位进行了分析。结果表明,LeGlyI的CDS序列全长为489 bp,共编码162个氨基酸;LeGlyⅠ蛋白分子式为C798H1226N214O235S4,分子量为17 706.05,等电点为6.51,GRAVY系数是-0.386,预测为亲水性稳定蛋白,含有一个VOC-like结构域。LeGlyI的启动子序列中包含多种顺式作用元件,包括无氧诱导必需的顺式作用元件、光响应元件、低温响应元件、干旱响应元件以及茉莉酸甲酯、脱落酸、生长素、赤霉素等激素响应元件。通过qRT-PCR分析发现,LeGlyI基因在番茄的根、茎、叶中均有表达,在叶中的表达量最高,并且其表达水平受氧化胁迫的影响。亚细胞定位结果显示LeGlyI蛋白主要在线粒体和细胞核中发挥功能。本研究结果可为深入研究LeGlyI基因在番茄抗逆中功能以及分子机制提供理论依据。

  文章目录

  1 材料与方法

  1.1 植物材料及试验处理方法

  1.2 LeGlyI基因的克隆

  1.3 LeGlyI蛋白的生物信息学分析

  1.4 LeGlyI的亚细胞定位分析

  1.5 LeGlyI基因表达分析

  2 结果与分析

  2.1 LeGlyI基因的克隆

  2.2 LeGlyI蛋白的生物信息学分析

  2.2.1 LeGlyI蛋白理化性质

  2.2.2 LeGlyI的系统进化分析

  2.2.3 LeGlyI启动子顺式作用元件分析

  2.3 LeGlyI的组织表达模式分析

  2.4 LeGlyI在Mv模拟氧化胁迫下的表达分析

  2.5 LeGlyI的亚细胞定位分析

  3 讨论与结论



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