摘要：【背景】多动物链球菌（Streptococcus pluranimalium，Sp）最先于1999年由Devriese等报道，是一种具有广泛宿主来源的潜在人畜共患病原体。目前的研究中，该菌种已从牛、羊、猪、肉鸡等多个物种的感染组织中被分离确认。然而，目前对其致病性、耐药性和基因组学等相关研究较少。【目的】从牛呼吸道分离鉴定一株Sp菌，分析其致病性及耐药性；通过基因组测序分析，明确其基因组的基本特征及部分毒力因子和耐药基因。【方法】通过患病牛鼻拭子采样，进行16S rRNA基因测序鉴定，开展对兔致病性试验和药敏试验；通过Illumina测序、组装以获取该菌株基因组一般特征信息，进行Swiss-Prot、NR、GO、COG、KEGG、CAZy、TCDB、Pfam数据库注释并分析基因功能，并通过PHI、VFDB、CARD数据库注释该菌株毒力因子及耐药基因。【结果】分离到一株多动物链球菌Bov5，可引起兔肺组织肺间隔增厚及炎性细胞浸润；药敏试验结果显示其对林可霉素和克林霉素耐药，对链霉素中介；全基因组测序组装后确定其基因组大小为2 038 579 bp（2.04 Mb），注释到的编码基因共计1 981个，注释到毒力因子100个，突变导致病原致病能力增强的基因28个，耐药相关基因48种。【结论】分离到一株具有较强致病性的牛源多动物链球菌，构建了菌株基因组框架图，挖掘出系列毒力和耐药相关基因，为进一步研究Sp致病基因和耐药基因奠定了基础。
文章目录
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 分离纯化与16S rRNA基因鉴定
1.3 致病性试验
1.4 药敏试验
1.5 建库及基因组测序、组装
1.6 基因组组分分析
1.7 基因功能注释
1.8 毒力或致病性分析
1.9 系统发育树构建
2 结果与分析
2.1 菌株鉴定及系统发育树分析结果
2.2 Bov5菌株感染可导致新西兰兔肺部病理损伤
2.3 Bov5基因组组装与全基因组组分分析结果
2.4 Bov5基因功能注释与预测结果
2.5 毒力和耐药性分析结果
3 讨论与结论
