基于加权基因共表达网络分析探究脑络欣通调控缺血性脑卒中炎症作用及分子机制

2024-05-22 安徽中医药大学学报60 1.13M 0

  摘要:目的 基于加权基因共表达网络分析(weighted correlation network analysis,WGCNA)探究脑络欣通治疗缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)的作用及分子机制。方法 首先从GEO数据库获取IS临床患者转录组数据,通过limma进行差异基因分析和借助WGCNA挖掘IS相关靶点。然后筛选脑络欣通的活性成分并预测其作用靶点。最后将基于WGCNA筛选出的靶点与预测的作用靶点进行取交集,并取关键成分与靶点进行分子对接验证。结果 WGCNA结果显示,脑络欣通活性成分作用的关键靶点有5个,即GLRX、ELANE、S100A8、BCL2A1和CAMP;KEGG富集分析揭示,脑络欣通主要通过调控白细胞介素(interleukin)IL-17和核因子(nuclear factor,NF)-κB炎症信号通路来达到抗IS的作用;分子对接结果验证了核心靶点中与其关键化合物具有良好的结合力。结论 脑络欣通治疗IS具有多成分、多靶点和多通路协同作用的特征,其分子机制可能是通过脑络欣通中主要活性成分对IL-17和NF-κB炎症信号通路的调控来达到治疗IS的作用。

  文章目录

  1 材料与方法

  1.1 差异基因的筛选

  1.2 核心基因的鉴定

  1.3 生物学功能富集分析及蛋白质—蛋白质相互作用(protein–protein interaction,PPI)

  1.4 活性化合物的筛选及靶点预测

  1.5 分子对接

  1.6 统计学方法

  2 结果

  2.1 差异基因的筛选

  2.2 核心基因的鉴定

  2.3 生物学功能富集分析及PPI网络构建

  2.4 脑络欣通活性成分筛选

  2.5 分子对接

  3 讨论



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