摘要:目的 基于加权基因共表达网络分析(weighted correlation network analysis,WGCNA)探究脑络欣通治疗缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)的作用及分子机制。方法 首先从GEO数据库获取IS临床患者转录组数据,通过limma进行差异基因分析和借助WGCNA挖掘IS相关靶点。然后筛选脑络欣通的活性成分并预测其作用靶点。最后将基于WGCNA筛选出的靶点与预测的作用靶点进行取交集,并取关键成分与靶点进行分子对接验证。结果 WGCNA结果显示,脑络欣通活性成分作用的关键靶点有5个,即GLRX、ELANE、S100A8、BCL2A1和CAMP;KEGG富集分析揭示,脑络欣通主要通过调控白细胞介素(interleukin)IL-17和核因子(nuclear factor,NF)-κB炎症信号通路来达到抗IS的作用;分子对接结果验证了核心靶点中与其关键化合物具有良好的结合力。结论 脑络欣通治疗IS具有多成分、多靶点和多通路协同作用的特征,其分子机制可能是通过脑络欣通中主要活性成分对IL-17和NF-κB炎症信号通路的调控来达到治疗IS的作用。
文章目录
1 材料与方法
1.1 差异基因的筛选
1.2 核心基因的鉴定
1.3 生物学功能富集分析及蛋白质—蛋白质相互作用(protein–protein interaction,PPI)
1.4 活性化合物的筛选及靶点预测
1.5 分子对接
1.6 统计学方法
2 结果
2.1 差异基因的筛选
2.2 核心基因的鉴定
2.3 生物学功能富集分析及PPI网络构建
2.4 脑络欣通活性成分筛选
2.5 分子对接
3 讨论