摘要：【目的】对工业大麻ZF-HD（Zinc finger-homeodomain）转录因子进行鉴定和表达模式分析，为ZF-HD功能研究及工业大麻遗传性状的改良提供理论参考。【方法】对5个工业大麻ZF-HD转录因子的基因结构、蛋白理化性质、蛋白系统进化关系和启动子顺式作用元件进行生物信息学分析，通过实时荧光定量PCR（qRT-PCR）对基因表达量进行检测。【结果】5个CsZF-HD基因分布于大麻基因组的2条染色体上，其编码序列长度为783～1185 bp，编码260～394个氨基酸残基，蛋白分子量27.95～43.33 ku，理论等电点为7.46～8.87。它们编码的蛋白均含有1个保守的ZF-HD＿dimer结构域，均为不稳定的亲水性蛋白且定位于细胞核中。ZF-HD蛋白家族分为3个亚族（A、B和C），CsZF-HD1和CsZF-HD2属于A亚族，CsZF-HD3属于C亚族，CsZF-HD4和CsZF-HD5属于B亚族。CsZF-HD1和CsZF-HD2在茎和叶中的表达量相差不明显，在根中表达量最低；CsZF-HD3在茎中的表达量最高，叶中表达量最低；CsZF-HD4在叶中的表达量最高，根中表达量最低；CsZF-HD5在根中表达量最高，茎中表达量最低。5个CsZF-HD基因均对盐和干旱胁迫响应，其中CsZF-HD1和CsZF-HD3在盐和干旱胁迫下表达量升高最明显。5个CsZF-HD基因启动子序列中均含有不同种类和数量的逆境相关顺式作用元件。【结论】ZF-HD转录因子可能在工业大麻应对盐和干旱胁迫时发挥转录调控作用。
文章目录
1 材料与方法
1.1 材料与处理
1.2 生物信息学分析
1.3 RNA提取及反转录cDNA
1.4 实时荧光定量RT-PCR（qRT-PCR）
2 结果与分析
2.1 CsZF-HD基因及蛋白序列分析
2.2 ZF-HD蛋白系统进化分析
2.3 CsZF-HD基因组织表达分析
2.4 CsZF-HD基因盐胁迫表达分析
2.5 CsZF-HD基因干旱胁迫表达分析
2.6 CsZF-HD基因启动子顺式作用元件预测分析
3 讨 论
4 结 论
