不同水域刀鲚和短颌鲚肠道菌群比较分析

2024-05-25 上海海洋大学学报90 1.38M 0

  摘要:为了探究鄱阳湖刀鲚(Coilia nasus)和短颌鲚(Coilia brachygnathus)的来源地,采集了长江干流、鄱阳湖、长江口和嵊泗海域,不同月份样本,运用16s rRNA高通量测序法,比较分析了它们肠道微生物差异,结果显示,(1)刀鲚不同群体之间,3月份彭泽段样本的肠道菌群丰富度显著高于鄱阳湖、青草沙和嵊泗的;PCoA 分析结果显示,4月份鄱阳湖刀鲚(PC-4)有一组样本以及青草沙的样本菌群组成与嵊泗(SC-3)的相似度高,提示它们可能是从嵊泗洄游而来。(2)在短颌鲚不同采样群体之间,不同水域短颌鲚肠道菌群差异较大,同一水域不同月份之间的差异较小,而5月份鄱阳湖短颌鲚的肠道菌群和其余月份显著不同,提示其可能从不同地方洄游而来。(3)鄱阳湖短颌鲚肠道菌群平均丰富度和多样性均高于鄱阳湖刀鲚的。以上肠道微生物组成分析表明,鄱阳湖的刀鲚和短颌鲚群体肠道菌群的分析结果看,它们可能都存在洄游群体。

  文章目录

  1材料与方法

  1.1 样品采集

  1.2 样品的处理

  1.3 细菌总DNA提取和测序

  1.4 高通量测序结果的生物信息学分析

  1.5 数据分析

  2 结果与分析

  2.1 肠道菌群的测序质量

  2.2 鄱阳湖不同月份及青草沙和嵊泗的刀鲚肠道菌群组成比较

  2.3 鄱阳湖和青草沙水库短颌鲚肠道菌群组成比较

  2.4 鄱阳湖刀鲚和短颌鲚肠道菌群对比

  3 讨论

  3.1 鄱阳湖刀鲚不同采样群体的肠道菌群差异

  3.2 鄱阳湖短颌鲚不同采样群体肠道菌群的差异

  3.3 鄱阳湖刀鲚与短颌鲚肠道菌群差异

  4 结论



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