摘要:为了探究鄱阳湖刀鲚(Coilia nasus)和短颌鲚(Coilia brachygnathus)的来源地,采集了长江干流、鄱阳湖、长江口和嵊泗海域,不同月份样本,运用16s rRNA高通量测序法,比较分析了它们肠道微生物差异,结果显示,(1)刀鲚不同群体之间,3月份彭泽段样本的肠道菌群丰富度显著高于鄱阳湖、青草沙和嵊泗的;PCoA 分析结果显示,4月份鄱阳湖刀鲚(PC-4)有一组样本以及青草沙的样本菌群组成与嵊泗(SC-3)的相似度高,提示它们可能是从嵊泗洄游而来。(2)在短颌鲚不同采样群体之间,不同水域短颌鲚肠道菌群差异较大,同一水域不同月份之间的差异较小,而5月份鄱阳湖短颌鲚的肠道菌群和其余月份显著不同,提示其可能从不同地方洄游而来。(3)鄱阳湖短颌鲚肠道菌群平均丰富度和多样性均高于鄱阳湖刀鲚的。以上肠道微生物组成分析表明,鄱阳湖的刀鲚和短颌鲚群体肠道菌群的分析结果看,它们可能都存在洄游群体。
文章目录
1材料与方法
1.1 样品采集
1.2 样品的处理
1.3 细菌总DNA提取和测序
1.4 高通量测序结果的生物信息学分析
1.5 数据分析
2 结果与分析
2.1 肠道菌群的测序质量
2.2 鄱阳湖不同月份及青草沙和嵊泗的刀鲚肠道菌群组成比较
2.3 鄱阳湖和青草沙水库短颌鲚肠道菌群组成比较
2.4 鄱阳湖刀鲚和短颌鲚肠道菌群对比
3 讨论
3.1 鄱阳湖刀鲚不同采样群体的肠道菌群差异
3.2 鄱阳湖短颌鲚不同采样群体肠道菌群的差异
3.3 鄱阳湖刀鲚与短颌鲚肠道菌群差异
4 结论